2002 május végén jelentette be Marilyn Manson, hogy régi gitárosa, Twiggy Ramirez nem tagja többé a csapatnak, és a készülő The Golden Age of Grotesque album munkálatait nélküle folytatják tovább. Hivatalos weboldalán az énekes a következőképp kommentálta az eseményt: „Nyolc hónapot töltöttem azzal, hogy a zenekart és az új dalokat összerázzam, és sajnos Twiggy képtelen volt kivenni a részét belőle. Úgy érzem, a Marilyn Manson egy életstílus, és ez nem áll közel az ő szívéhez, úgy döntöttem hát, hogy elengedem őt, járja a saját útját, máskülönben nem lett volna fair magunkkal, a zenénkkel és legfőképpen a rajongóinkkal szemben. Bár sohasem lehet pótolni egy olyan jó barátot, mint Twiggy, ez az album és az új felállás újra fogja fogalmaztatni a Marilyn Mansonról alkotott képet. Remélem, a döntésem mindannyiunknak a legjobbat fogja hozni. Ebben a szituációban nincs rossz és jó fickó. Twiggy, hiányozni fogsz, és őszintén remélem, meg fogod találni azt, ami igazán boldoggá tesz. Mindig itt leszek, ha szükséged van rám, és ezt komolyan gondolom!" A hírt a Marilyn Manson rajongótábor nagy megdöbbenéssel fogadta, sokunknak nagy csalódást okozott a banda egyik ékességének távozása. Twiggy helyét a KMFDM frontembere, Tim Skold tölti be, mellesleg az új album társproducere is egyben.

Az új albumot Manson még 2002 elején kezdte el írni, és hosszas várakozások után is csak felületes utalásokat tett a készülődő anyagra: „Ez a leglényegretörőbb anyag, amit valaha összeállítottunk, így nem lett olyan terjedelmű, mint az ezt megelőzőek. Ez nem azt jelenti, hogy kevesebb tartalommal bír, hanem szerintem néha a kevesebb is kifejezheti azt, amit egy komplex darab, nagyobb terjedelmű alkotás.” Sokat említette, hogy a lemez fő inspirálója a 30-as évek Berlinje, a burleszk és a kabaré világa, a művészetek, és ezek dekadenciája, és a groteszk légkör, ami ezt az időszakot jellemezte. Elmodta azt is, hogy nagyrészt barátnője, Dita Von Teese inspirálta; ő hozta elő benne ezt az oldalát, mely már régóta ott lakozott. Zeneileg összefoglalva: „Egészen különleges lesz. Zeneileg súlyos cucc várható, punkosan kemény, vad ütemekkel, de egy csomó elektronikával. A múltkor valakinek megmutattunk pár dalt, és azt mondta, hogy tök olyan, mint egy 2002-es Sex Pistols, de tele dobgépekkel, elektronikával, bizarr ritmusokkal. Ugyanakkor tök rock lesz az egész, szakítóan rockos! Meg arrogáns, pimasz és dühös…”

Manson első festménykiállítása 2002 szeptember 19-én és 20-án került megrendezésre, melyen kb. 50 darab 1997 és 2002 között készült vízfestményét állították ki. Ez volt az első alkalom, hogy a sokarcú Mr Manson ezen művészi oldalát is megismerhettük.

Október 29-én jelent meg a banda első DVD-je, a Guns, God and Government World Tour-ról készült koncertösszefoglaló. Az anyag tartalmaz rengeteg élő felvételt a 2001-2002-es turné majdnem összes helyszínéről, valamint egy kisfilmet, mely bekukkant a kulisszák mögé, mellesleg a ’Death Parade’ címet viseli.

A 2003-as évet rögtön egy feldolgozással kezdték, mégpedig elkészítették a The KKK Took My Baby Away című Ramones szám átiratát, mely a We’re A Happy Family című tribute-albumra került fel.